Начальная стадия гломерулонефрита или обострение хронического процесса также проявляет наличие нейтрофильных лейкоцитов, при этом процент лимфоцитов незначительный. Но соотношение клеток не такое критическое, как на фоне инфекций, и постепенно нейтрофилы уменьшаются в объемах, а уровень лимфоцитов возрастает. По мере разгара болезни лимфоциты будут уже преобладать. Типичным для гломерулонефрита будет еще и наличие мононуклеаров.
При аллергическом нефрите моча содержит высокий процент эозинофильных лейкоцитов, при врожденных аномалиях почек и на фоне нефропатий преобладают лимфоциты.